Giovanni Boniolo: opere
- 1997 Filosofia della fisica
- 1999 Filosofia della scienza, B. Mondadori, Milano, [rif.]
- 1999 Metodo e rappresentazioni del mondo, Bruno Mondadori, [rif.]
- 2001 La legge di natura. Analisi storico-critica di un concetto, McGraw-Hill Italia, Milano, [rif.]
- a cura di: idem, M. Dorato
- 2003 Il limite e il ribelle. Etica, naturalismo, darwinismo, Cortina
- 2003 Introduzione alla filosofia della scienza, Bruno Mondadori, Milano, [rif.]
- 2004 Argomentare, Bruno Mondadori, Milano
- 2005 The Role of Mathematics in Physical Sciences, Springer, Dordrecht, [rif.]
- a cura di: id., P. Budinich, M. Trobok
- 2006 Evolutionary Ethics and Contemporary Biology, Cambridge University Press
- a cura di: idem, G. De Anna
- 2006 Laicità, Einaudi
- 2007 Individuo e persona. Tre saggi su chi siamo, Bompiani
- con: G. De Anna, U. Vincenti
- 2007 On Scientific Representations. From Kant to a New Philosophy of Science, Palgrave Macmillan
- 2008 Filosofia e scienze della vita
- 2011 Il pulpito e la piazza.Democrazia, deliberazione e scienze della vita, Cortina, Milano
- 2011 Strumenti per ragionare